В кале могут быть обнаружены патогенные и непатогенные простейшие.
К патогенным простейшим, обнаруживаемым в кале, относятся дизентерийная амеба (Entamoeba histolytica), балантидий кишечный (Balantidium coli), вызывающий тяжелое поражение кишечника, кишечные трихомонады (Trichomonas hominis), вызывающие более или менее выраженное заболевание кишечника.
Патогенность лямблий (Lamblia intestinalis), цисты и реже вегетативные особи которых могут быть обнаружены в кале, большинство авторов ставят под сомнение.
Из непатогенных простейших в кале находят кишечную амебу (Entamoeba coli), энтамебу Гартмана (Entamoeba hartmanni), йодамебу Бючли (Iodamoeba butschlii).
При исследовании можно использовать только свежевыделенный кал, причем не позднее чем через 15—20 мин. Нужно учитывать, что однократный отрицательный результат не может считаться окончательным. В этом случае необходимо повторно произвести 4—5 исследований с перерывом в 2—3 дня, а также использовать методы концентрации (метод осаждения, эфирно-формалиновый метод и т. п.).